پیمان عارف پس از اعتراضات به انتخابات رژیم (۱۳۸۸) دستگیر شده و از سوی شعبه ۲۶ دادگاه تهران توسط قاضی جنایتکار پیرعباسی به جرم داشتن تجهیزات ماهواره و فعالیت تبلیغی علیه نظام و عضویت در گروههای غیر قانونی (اپوزیسیون)، به تحمل دو سال و نیم زندان تعزیری، و ۷۴ ضربه شلاق و محرومیت ۱۵ سال از هر گونه فعالیت مطبوعاتی و حضور در تشکلهای سیاسی محکوم شد.
او در مهر ماه ۱۳۹۰ پس از اجرای حکم ۷۴ ضربه شلاق به جرم توهین به احمدی نژاد از زندان آزاد شد و ۲ هفته پس از آزادی، در آذر ۱۳۹۰ بهعلت مصاحبه با رسانههای خارجی و همچنین حضور بر مزار ندا آقا سلطان مجددا بازداشت و به زندان اوین منتقل گردید.
پیمان عارف چند روز پس از اجرای حکم در گفت و گویی با سایت کلمه گفت:»در شرایط نیمه هشیاری و حال ناخوشی که بعد از اجرای شلاق تعزیری به صورت جدی داشتم، خاطرم هست که از کارمند دادیاری اجرای احکام کاغذی خواستم و خطاب به دادستان تهران همان جا فی المجلس شکایتم را اعلام کردم و خواهان دستور قضایی برای پیگرد قانونی شدم.»
پیمان عارف گفت که احمدی نژاد که هر بار به نیویورک می رود و می گوید ما آزادترین کشور دنیا را داریم اما مرا اینجا در کشور خودم ، به وحشیانه ترین شکل ممکن به جرم توهین به احمدی نژاد شلاق زده اند. من یک نامه سرگشاده به احمدی نژاد نوشتم و تنها یاد آوری کردم که چه بلایی سر دانشگاهها آمده است.
بنا به گزارشات پیمان عارف، خسرو کردپور، مسعود کردپور و هوتن در زندان تحت فشار های روحی بسر میبرند و از وضعیت ایشان اطلاعی در دست نیست.

